Pesquisa de epítopos virais in silico utilizando bioinformática na fabricação de imunoterápicos de relevância clínica

João Paulo Romualdo Alarcão Bernardes, Sarah Maria da Silva Napoleão, Kelly Cristina Simi

Resumo


A imunologia é a ciência que estuda os mecanismos utilizados pelo nosso organismo no combate a patógenos tais como os vírus Zika e Chikungunya. A bioinformática é uma ciência recente que permite o estudo de diversos processos imunológicos através de softwares de computador. A utilização de ferramentas oriundas da bioinformática possibilita o estudo e predição de estruturas proteicas de diversos patógenos. Esses estudos geralmente estão relacionados com pesquisas de sequências proteicas em banco de dados, para formulação de estruturas tridimensionais de proteínas e predição de epítopos virais que possam gerar uma resposta efetiva do sistema imunológico. Os resultados dessa pesquisa auxiliam no processo de formulação e fabricação de moléculas para utilização em terapias alternativas, como a imunoterapia e desenvolvimento de vacinas, que pudesse ser mais eficiente e específico antes do início de testes em bancada, otimizando assim tempo e recursos. A metodologia utilizada foi aquisição dos epítopos através do banco de dados IEDB, em seguida foi feito reconhecimento das proteínas encontradas pelo site UniProt, foi feita também a análise conformacional das proteínas encontradas e validadas juntamente com o processo de validação in silico dos epítopos encontrados pelo próprio IEDB, a partir desses achados foi possível fazer o rank dos epítopos mais promissores. Foi possível utilizar estratégia de filtragem de dados para proporcionar informações básicas e relevantes para processos como modelagem de proteínas 3D e sugestão de alelos que podem ser utilizados em experimentos in vitro. A pesquisa in silico é um método de pesquisa muito recente e promissor, e se faz necessário o estudo nessa área para auxiliar os métodos in vitro e in vivo da predição de epítopos relevantes para fabricação de vacinas e imunoterápicos

Palavras-chave


Bioinformática. Epítopos. Zika.

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DOI: http://dx.doi.org/10.5102/pic.n1.2018.6397

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